研究内容
- DNAは核内において高次構造をとって収納され、このクロマチン高次構造がゲノム情報の維持や遺伝子の発現調節に重要であることが知られており、癌を始めとした疾患においても様々なクロマチン構造異常が起きていることが知られています。
- 私は、Hi-Cや4C-seqといったクロマチン高次構造解析手法を用いて、胃癌を中心に癌化の原因となる構造異常とそのメカニズムを解明することを目的として研究を進めています。
代表論文
- Okabe A, Kaneda A. Transcriptional dysregulation by aberrant enhancer activation and rewiring in cancer. Cancer Sci、112(6)、2081-2088、2021
- Okabe A, Huang KK, Matsusaka K, Fukuyo M, Xing M, Ong X, Hoshii T, Usui G, Seki M, Mano Y, Rahmutulla B, Kanda T, Suzuki T, Rha SY, Ushiku T, Fukayama M, Tan P, Kaneda A. Cross-species chromatin interactions drive transcriptional rewiring in Epstein–Barr virus positive gastric adenocarcinoma. Nat Genet 52(9), 919-930, 2020
- Okabe A, Kaneda A. Epigenetic aberration at enhancer regions in gastric cancer. J Cancer Treat Diagn, 2: 31-35, 2018.
- Okabe A, Funata S, Matsusaka K, Namba H, Fukuyo M, Rahmutulla B, Oshima M, Iwama A, Fukayama M, Kaneda A. Regulation of tumour related genes by dynamic epigenetic alteration at enhancer regions in gastric epithelial cells infected by Epstein-Barr virus. Sci Rep, 7: 7924, 2017.
外部資金
- 科学研究費補助金 若手 2019-2020
- 国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(A)) 2020
- 科学研究費補助金 基盤研究(B) 2022-2024
- 2021年度日本新薬公募研究助成
- 2022年度みらい医療基金医学研究助成
- 2022年度武田科学振興財団医学系研究助成
- 持田記念医学薬学振興財団2022年度研究助成金
受賞等
- 第32回日本消化器癌発生学会総会優秀演題賞
- 日本エピジェネティクス研究会2021年奨励賞
- 15th Asian Epigenomic Meeting 2021 Outstanding Research Award
- 2021年日本癌学会奨励賞